Targets for snoRNAs¶

Putative modification sites in RNAs of Cryptococcus, compared to those in RNAs of bakers’s yeast or human [1], are annotated below. Nucleotides not described as modified in other organisms are indicated as N.

Saccharomyces cerevisiae		Cryptococcus deneoformans
ETS1 pre-rRNA
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18S SSU rRNA
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ITS1 pre-rRNA
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5.8S LSU rRNA
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ITS2 pre-rRNA
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25S LSU rRNA
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Homo sapiens		Cryptococcus deneoformans
5S LSU rRNA
gtctacggccataccaccctgaacgcgcccgatctcgtctgatctcggaagctaagcagg gtcgggcctggttagtacttggatgggagaccgcctgggaataccgggtgctgtaggct		ttatccacggccataGccttcatacagcaccctgccccgtccgatccaggaagttaagct gaagagcgctcggttagtaccacggtgggggaccacgtgggaatcccgggtgccgtggtt ctctt
U1 snRNA
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U2 snRNA
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U4 snRNA
agctttgCgcagtggcagtatcgtagccaatgaggtttatccgaggcgcgattattgcta attgAaaacttttcccaataccccgccgtgacgacttgcaatatagtcggcattggcaat ttttgacagtctctacggag		agtccttgtgctagggttagagcttctgacagtgaggagaaatccgagtcgaagcaattg ctgattgcaaaaaatatcctacacgtaatgtccatcgtaaggtgtgacattcaatttctg gcaaagtacactttgattgtacactgagtttt
U5 snRNA
atactctggtttctcttcagatcgcataaatctttcgcctTtTaC TaaagatTtccgtgg agaggaacaactctgagtcttaacccaattttttgagccttgctccgacaaggcta		agcgggggatcaaacacaaatcgaataaatctctcgcctTttactagagatatccgtgta tttggtccgcaaacccgcgttcaaatttgttccacacccatttccttgggct
U6 snRNA
gtgctcgcttcggcagcacatatactaaaaTtggaacgaTacagagAagattAgcatggC cCctgcgcaaggatgaCacgcaaatTcgtgaagcgttccatatttt		tgttgccaccttcgggtcggcataagaaaaattggaacaatacagagAagattagcattg cccctgcataaggatgacaaactcgagcagagaggaggttcttcggaaccaaatatttttt

Modifying box C/D snoRNAs¶

SnoRNAs, grouped per transcription unit (see also the snoRNA table).

Notes¶